Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim15G3UY57 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim15G3UY57 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms