Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Farp1F8VPU2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Farp1F8VPU2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms