Protein–RNA interactions for Protein: F6ZL36

Gm17606, Predicted gene, 17606, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17606F6ZL36 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm17606F6ZL36 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms