Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8247F6VRJ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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