Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp988F6VKC7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp988F6VKC7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp988F6VKC7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms