Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28305F6U473 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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