Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cald1E9QA15 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cald1E9QA15 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms