Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930451I11RikE9Q9R3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930451I11RikE9Q9R3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms