Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdh18E9Q9Q6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdh18E9Q9Q6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms