Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col22a1E9Q7P1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms