Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Simc1E9Q6E9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Simc1E9Q6E9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms