Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pgbd1E9Q492 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pgbd1E9Q492 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms