Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ApobE9Q414 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms