Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms