Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
5430401F13RikE9Q328 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
5430401F13RikE9Q328 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms