Protein–RNA interactions for Protein: E9Q289

Acbd4, Acyl-Coenzyme A-binding domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd4E9Q289 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Acbd4E9Q289 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms