Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NebE9Q1W3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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