Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt78E9Q0F0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt78E9Q0F0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms