Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3095E9Q058 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3095E9Q058 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms