Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm4450E9Q007 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm4450E9Q007 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms