Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcn1E9PVA8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gcn1E9PVA8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gcn1E9PVA8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gcn1E9PVA8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gcn1E9PVA8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gcn1E9PVA8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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