Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam53aE9PV82 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53aE9PV82 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms