Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Cngb1E1AZ71 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms