Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
5430403G16RikD3Z5L4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms