Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc8D3YZV8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc8D3YZV8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms