Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc6D3YZP9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc6D3YZP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms