Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rexo5D3YW29 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rexo5D3YW29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms