Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lce6aD3YV94 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lce6aD3YV94 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms