Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc13D3YV10 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms