Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm17333C6EQI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm17333C6EQI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm17333C6EQI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm17333C6EQI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm17333C6EQI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm17333C6EQI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm17333C6EQI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm17333C6EQI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm17333C6EQI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm17333C6EQI3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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