Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmf1B9EKI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmf1B9EKI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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