Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdzd8B9EJ80 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd8B9EJ80 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms