Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clip3B9EHT4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms