Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apol6B7ZC55 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apol6B7ZC55 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms