Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phf11bB4XVQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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