Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Phf11cB4XVP9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf11cB4XVP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms