Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pnldc1B2RXZ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnldc1B2RXZ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms