Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc11B2RXC1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc11B2RXC1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms