Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cspp1B2RX88 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms