Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah3B2RWG3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms