Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cfap58B2RW38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cfap58B2RW38 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms