Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms