Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Otud4B2RRE7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud4B2RRE7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms