Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf518bB2RRE4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms