Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc2B2RR83 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ythdc2B2RR83 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ythdc2B2RR83 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms