Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brpf3B2KF05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf3B2KF05 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms