Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn7aB1AYL1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn7aB1AYL1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms