Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nipsnap3aB1AWZ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms