Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930402K13RikB1AW18 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402K13RikB1AW18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 447.2 ms