Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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